Tingimused, mis vallutasid liidu sõdurid, püsisid Konföderatsioonis Andersonville'i vangla olid kohutavad. Vangla tegutsemise 18 kuu jooksul suri ligi 13 000 liidu sõdurit alatoitumus, haigused ja kokkupuude elementidega Andersonville'i ülema ebainimliku kohtlemise tagajärjel Henry Wirz. Nii et tegelikult ei tohiks olla üllatav, et tema süüdistamine sõjakuritegude eest pärast Lõuna loovutamist on kõige tuntum kohtuprotsess, mis tuleneb Kodusõda. Kuid pole nii üldteada, et konföderatsioonide sõjalisi süüdistusi oli veel tuhatkond. Paljud neist olid tingitud vangistatud liidu sõdurite väärkohtlemisest.
Henry Wirz
Henry Wirz asus Andersonville'i vangla juhtima 27. märtsil 1864, umbes kuu aega pärast esimeste vangide saabumist. Üks Wirzi esimesi tegusid oli luua surnud piirdeaiaks nimetatud ala, mille eesmärk oli suurendada turvalisust, hoides vange stokkuseinast eemal. Vangla valvurid tulistasid kõiki vange, kes ületasid surnud piiri. Wirzi väejuhatuse ajal kasutas ta vange rivis hoidmiseks ähvardusi. Kui ähvardused ei töötanud, käskis Wirz saatjatel vange tulistada. Sisse
Mai 1865, Wirz arreteeriti Andersonville'is ja toimetati Washington DC. kohtuprotsessi ootama. Wirzit mõisteti süüdi vangistatud sõdurite vigastamise ja / või tapmise pärast, keelates neile juurdepääsu toidule, meditsiinitarvetele ja rõivastele. Samuti süüdistati teda mõrvas paljude vangide isikliku hukkamise eest.Ligikaudu 150 tunnistajat tunnistasid Wirzi vastu tema sõjalisel kohtuprotsessil, mis kestis 23. augustist 18 oktoobrini 1865. Pärast kõigi talle esitatud süüdistuste süüdi mõistmist mõisteti Wirz surma ja ta riputati 10. novembril 1865.
James Duncan
James Duncan oli veel üks Andersonville'i vangla ohvitser, kes samuti arreteeriti. Kvartalimeistri kabinetti määratud Duncan mõisteti tapmises süüdi vangidelt toidu tahtliku kinnipidamise eest. Ta mõisteti 15 aastaks raskeks tööks, kuid pääses pärast karistuse kandmist ainult ühe aasta jooksul.
Champ Ferguson
Kodusõja alguses oli Champ Ferguson Ida-Tennessee põllumees. Selle piirkonna elanikkond jagunes liidu ja Konföderatsiooni toetamise vahel üsna võrdselt. Ferguson korraldas sissifirma, mis ründas ja tappis liidu pooldajaid. Ferguson tegutses ka koloneli skaudina John Hunt Morgani Kentucky ratsavägi, ja Morgan ülendas Fergusoni Partisan Rangersi kapteniks. Konföderatsiooni kongress võttis vastu meetme nimega Partisan Ranger Act, mis lubas värvata teenistusse rikkujaid. Tuleb märkida, et partisanide Rangersi distsipliini puudumise tõttu kindral Robert E. Lee kutsus seda kehtetuks tunnistama konföderatsiooni kongressil 1864. aasta veebruaris. Pärast sõjatribunalis peetud kohtuprotsessi mõisteti Ferguson süüdi enam kui 50 vangistatud liidu sõduri tapmises. Ta hukati riputamisega oktoobris 1865.
Robert Kennedy
Robert Kennedy oli liidu jõudude poolt vangistatud konföderatsiooni ohvitser ja ta vangistati Johnsoni saare sõjaväe vanglas. Vangla asus Sandusky lahes, mis asub Erie järve rannikul vaid mõne miili kaugusel Ohio osariigis Sanduskyst. Kennedy põgenes Johnsoni saarelt oktoobris 1864, asudes Kanadasse - see säilitas neutraalsuse mõlema poole suhtes. Kennedy kohtus mitme konföderatsiooni ohvitseriga, kes kasutasid Kanadat liidu vastu sõjategevuse läbiviimiseks. Ta osales plaane tulekahjude puhkemiseks paljudes hotellides, samuti New Yorgi muuseumis ja teatris, kavatsusega kohalikele omavalitsustele üle jõu käia. Kõik tulekahjud kustutati kiiresti või ei suutnud nad kahju teha. Kennedy oli ainus, kes tabati. Pärast sõjatribunalis peetud kohtuprotsessi hukati Kennedy 1865. aasta märtsis riputamisega.