Tänapäeval teadlastele kättesaadava tehnoloogia abil on evolutsiooniteooriat tõenditega toetamiseks palju võimalusi. DNA sarnasused liikide vahel, teadmised arengubioloogiaja muid mikroevolutsiooni tõendeid on arvukalt, kuid teadlastel pole alati olnud võimalusi seda tüüpi tõendeid uurida. Kuidas nad toetasid evolutsiooniteooriat enne neid avastusi?
Peamine viis, kuidas teadlased on toetanud Evolutsiooni teooria Kogu ajaloo vältel kasutatakse organismide anatoomilisi sarnasusi. Näidatakse, kuidas ühe liigi kehaosad sarnanevad teise liigi kehaosadega, samuti kogunevaid kohandusi kuni struktuurid muutuvad omavahel mitteseotud liikide sarnasemaks, on evolutsiooni mõnevõrra toetatud anatoomiliste tõenditega. Muidugi leidub alati pikaajaliselt väljasurnud organismide jälgi, mis võivad anda ka hea pildi sellest, kuidas liik aja jooksul muutus.
Elutegevuse jälgi minevikust nimetatakse fossiilideks. Kuidas annavad fossiilid tõendusmaterjali evolutsiooniteooria toetuseks? Luud, hambad, kestad, jäljed või isegi täielikult säilinud organismid võivad maalida pildi sellest, milline oli elu pikka aega tagasi. See mitte ainult ei anna meile vihjeid pikka aega väljasurnud organismidele, vaid võib ka spetsifitseerimise käigus näidata liikide vahevorme.
Teadlased saavad kasutada fossiilidelt saadud teavet, et paigutada vahevormid õigesse kohta. Fossiili vanuse leidmiseks võivad nad kasutada suhtelisi ja radiomeetrilisi või absoluutseid tutvumisi. See võib aidata täita lünki teadmistes, kuidas liik liikus kogu ajavahemikul ühelt perioodilt teiseleGeoloogiline ajakava.
Ehkki mõned evolutsiooni vastased väidavad, et fossiilide register on tõestusmaterjal evolutsiooni puudumise kohta, kuna fossiilide dokumendis on puuduvad lingid, ei tähenda see, et evolutsioon oleks vale. Fossiile on väga raske luua ja surnud või lagunevast organismist fossiiliks muutumiseks peavad olud olema õiged. Tõenäoliselt on ka palju avastamata fossiile, mis võiksid mõned lüngad täita.
Kui eesmärk on välja selgitada, kui tihedalt kaks liiki on seotud fülogeneetilise elupuuga, tuleb uurida homoloogseid struktuure. Nagu eespool mainitud, pole haid ja delfiinid tihedalt seotud. Delfiinid ja inimesed siiski on. Üks tõendusmaterjal, mis toetab ideed, et delfiinid ja inimesed on pärit ühiselt esivanemalt, on nende jäsemed.
Delfiinidel on eesmised klapid, mis aitavad ujumisel vähendada vees hõõrumist. Kui aga vaadata läbilõike luid, on lihtne näha, kui sarnane on see inimkäe struktuuriga. See on üks viis, kuidas teadlased klassifitseerivad organisme fülogeneetilistesse rühmadesse, mis hargnevad ühiselt esivanemalt.
Ehkki delfiin ja hai näevad keha kuju, suuruse, värvi ja uime asukoha poolest väga sarnased, ei ole need tihedalt seotud fülogeneetilise elupuuga. Delfiinid on inimestega tegelikult palju tihedamalt seotud kui haid. Miks nad näevad nii palju välja, kui pole omavahel seotud?
Vastus peitub evolutsioonis. Liigid kohanevad oma keskkonnaga, et täita vaba nišš. Kuna haid ja delfiinid elavad vees sarnases kliimas ja piirkonnas, on nad sarnased nišš mida peab selles valdkonnas täitma midagi. Sarnases keskkonnas elavad ja ökosüsteemides sama tüüpi vastutusega liigid kipuvad kogunema kohanemisteks, mis muudavad nad üksteisega sarnaseks.
Seda tüüpi analoogsed struktuurid ei tõesta, et liigid on omavahel seotud, pigem toetavad nad Evolutsiooni teooria, näidates, kuidas liigid ehitavad üles kohanemisi, et nendesse sobituda keskkonnad. See on liikumapanev jõud liigituse muutumisel või liikide muutumisel aja jooksul. See on definitsiooni järgi bioloogiline evolutsioon.
Mõnedel organismi kehaosadel või kehaosadel pole enam mingit nähtavat kasutamist. Need on liigi varasema vormi jäägid enne spetsialiseerumist. Ilmselt kogunes liikidele mitu kohandust, mis muutis lisaosa enam kasulikuks. Aja jooksul lakkas osa töötamast, kuid ei kadunud täielikult.
Enam mitte kasulikke osi nimetatakse vestigiaalseteks struktuurideks ja inimestel on neist mitu, sealhulgas tagaluu ei ole sellega ühendatud saba ja apendiksiks nimetatud elund, millel pole nähtavat funktsiooni ja mis võib olla eemaldatud. Mingil evolutsiooni ajal polnud need kehaosad enam ellujäämiseks vajalikud ja nad kadusid või lakkasid toimimast. Vestigiaalsed struktuurid on fossiilid organismi kehas, mis annavad vihjeid liikide varasematele vormidele.