Üks muistsele inimesele teada olnud orgaanilisi keemilisi reaktsioone oli seepide valmistamine reaktsiooni teel, mida nimetatakse seebistamine. Naturaalsed seebid on rasvhapete naatrium- või kaaliumsoolad, mis on algselt valmistatud seapeki või muu loomse rasva keetmisel koos leelise või kaaliumhüdroksiidiga. Rasvade hüdrolüüs ja õlid tekivad, saagiseks glütserool ja toorseep.
Seebi, rasva (rasva loomadelt nagu veised ja lambad) või taimerasva kuumutatakse naatriumhüdroksiidiga. Kui seebistumisreaktsioon on lõppenud, lisatakse seebi sadestamiseks naatriumkloriidi. Veekiht eemaldatakse segu ülaosast ja glütserool eraldatakse vaakumi abil destilleerimine.
Seebistamisreaktsioonis saadud toores seep sisaldab naatriumkloriidi, naatriumhüdroksiidi ja glütserooli. Need lisandid eemaldatakse toorprodukti keetes vees ja seebi uuesti sadestamisega soolaga. Pärast puhastamisprotsessi mitu korda korramist võib seepi kasutada odavana tööstusliku puhastusvahendina. Puhastusseebi saamiseks võib lisada liiva või pimsskivi. Muud protseduurid võivad põhjustada pesu-, kosmeetika-, vedelike ja muid seepe.
Pehme seep: Pehme seebi valmistamiseks kasutatakse naatriumhüdroksiidi asemel kaaliumhüdroksiidi (KOH). Lisaks sellele, et seda tüüpi seep on pehmem, on selle madalam sulamistemperatuur. Enamiku varajaste seepide valmistamiseks kasutati kaaliumhüdroksiidi, mis oli saadud puutuhast ja loomsetest rasvadest. Kaasaegsete pehmete seepide valmistamiseks kasutatakse taimeõlisid ja muid polüküllastumata triglütseriide. Neid seepe iseloomustab nõrgem molekulidevahelised jõud soolade vahel. Need lahustuvad kergesti, kuid kipuvad ka mitte nii kaua vastu pidama.
Liitiumseep: Leelismetallide rühmas perioodiliste tabelite liikumisel peaks ilmne olema, et seepi võib valmistada liitiumhüdroksiidi (LiOH) abil sama hõlpsalt kui NaOH või KOH. Liitiumseepi kasutatakse määrderasvana. Mõnikord valmistatakse keerulisi seepe kasutades liitiumseepi ja ka kaltsiumseepi.
Mõnikord toimub seebistumisreaktsioon tahtmatult. Õlivärv tuli kasutusele, kuna see talus ajaproovile. Aja jooksul on seebistumisreaktsioon viinud paljude (kuid mitte kõigi) viieteistkümnendal kuni kahekümnendal sajandil tehtud õlimaalide kahjustuseni.
Reaktsioon toimub siis, kui raskmetallide soolad, näiteks punases pliis, tsingvalges ja pliivalges sisalduvad soolad reageerivad õlis sisalduvate rasvhapetega. Reaktsiooni käigus tekkivad metall seebid kipuvad liikuma maali pinna poole, põhjustades pinna deformeerumist ja tekitades kriidist värvuse muutust mida nimetatakse "õitsenguks" või "õisikuks". Ehkki keemilise analüüsi abil on võimalik seebistamist enne selle ilmnemist kindlaks teha, siis pärast protsessi algust seda pole ravida. Ainus tõhus taastamisviis on retušeerimine.
Ühe grammi rasva seebistamiseks vajalikku kaaliumhüdroksiidi milligrammi arvu nimetatakse selle omaks seebistamisnumber, Koettstorferi number või "sap". Seebistamisnumber kajastab ühendi rasvhapete keskmist molekulmassi. Pika ahelaga rasvhapetel on madal seebimisväärtus, kuna need sisaldavad molekuli kohta vähem karboksüülhappe funktsionaalrühmi kui lühikese ahelaga rasvhapped. Mahla väärtus arvutatakse kaaliumhüdroksiidi jaoks, nii et naatriumhüdroksiidi abil valmistatud seebi puhul tuleb selle väärtus jagada 1,403-ga, mis on KOH ja NaOH molekulmasside suhe.
Mõningaid õlisid, rasvu ja vahasid peetakse seebistamatu. Naatriumhüdroksiidi või kaaliumhüdroksiidiga segamisel need ühendid ei moodusta seepi. Seebistamatute materjalide näideteks on mesilasvaha ja mineraalõli.