Evolutsiooni teooriat toetavaid tõendeid on palju. Need tõendid ulatuvad minimaalsetest DNA molekulaarsete tasemeteni kuni organismide anatoomilise struktuuri sarnasusteni. Millal Charles Darwin esitas esmakordselt oma idee looduslik valik, kasutas ta peamiselt tõendusmaterjali, mis põhineb anatoomilised tunnused organismidest, mida ta uuris.
Neid anatoomiliste struktuuride sarnasusi saab klassifitseerida kahel viisil analoogsed struktuurid või homoloogsed struktuurid. Kuigi mõlemad need kategooriad on seotud sellega, kuidas erinevate organismide sarnaseid kehaosi kasutatakse ja struktureeritakse, on tegelikult ainult üks viide ühisele esivanusele kuskil minevikus.
Analoogia
Analoogia või analoogsed struktuurid on tegelikult see, mis ei viita sellele, et kahe organismi vahel oleks hiljuti ühine esivanem. Vaatamata sellele, et uuritavad anatoomilised struktuurid näevad välja sarnased ja võivad isegi täita samu funktsioone, on need tegelikult toote toode ühtlane evolutsioon. See, et nad näevad välja ja tegutsevad sarnaselt, ei tähenda, et nad oleksid elupuuga tihedalt seotud.
Ühine evolutsioon on see, kui kahes sõltumatus liikis toimub mitu muutust ja kohanemist, et muutuda sarnasemaks. Tavaliselt on need kaks liigid elada sarnases kliimas ja keskkonnas erinevates maailma osades, mis soosivad samu kohandusi. Analoogsed omadused aitavad sel liikil keskkonnas ellu jääda.
Üks näide analoogsetest struktuuridest on nahkhiirte, lendavate putukate ja lindude tiivad. Kõik kolm organismi kasutavad tiibu lendamiseks, kuid nahkhiired on tegelikult imetajad ja pole sugugi seotud lindude ega lendavate putukatega. Tegelikult on linnud dinosaurustega tihedamalt seotud kui nahkhiirte või lendavate putukatega. Linnud, lendavad putukad ja nahkhiired kohanesid oma keskkonnas niššidega tiibade arendamise kaudu. Kuid nende tiivad ei näita lähedast evolutsioonilist suhet.
Teine näide on hail ja delfiinil olevad uimed. Haid klassifitseeritakse kalaperekonda, delfiinid aga imetajad. Mõlemad elavad aga sarnases keskkonnas ookeanis, kus uimed on soodsaks kohanduseks loomadele, kes peavad vees ujuma ja liikuma. Kui nad on elupuul piisavalt kaugele jälile jõutud, on lõpuks nende kahe jaoks ühine esivanem, kuid see ei oleks nii võib pidada hiljutiseks ühiseks esivanemaks ja seetõttu peetakse hai ja delfiini uimed analoogseteks struktuurideks.
Homoloogia
Sarnaste anatoomiliste struktuuride teist klassifikatsiooni nimetatakse homoloogia. Homoloogias kujunesid homoloogsed struktuurid tegelikult välja hiljuti ühiselt esivanemalt. Organismid koos homoloogne struktuurid on elupuul üksteisega tihedamalt seotud kui analoogsete struktuuridega.
Kuid nad on endiselt tihedalt seotud hiljutise ühise esivanemaga ja tõenäoliselt on need läbinud erinev evolutsioon.
Erineva evolutsiooniga muutuvad lähedaste liikide struktuur ja funktsioon vähem sarnasteks loodusliku valiku käigus omandatud kohanemiste tõttu. Uuele kliimale üleminek, konkurents nišid teiste liikidega ja isegi mikroevolutsioonilised muutused nagu DNA mutatsioonid võib aidata kaasa erinevale evolutsioonile.
Homoloogia näiteks on inimestel saba luu koos kasside ja koerte sabadega. Samal ajal kui meie kuklaluust või sabakonnast on saanud a vestigiaalne struktuur, kassidel ja koertel on sabad endiselt terved. Võimalik, et meil ei ole enam nähtavat saba, kuid nääripuu struktuur ja tugikondid on väga sarnased meie koduloomade sabakontidega.
Taimedel võib olla ka homoloogia. Kaktusel olevad tikkjad ja tammepuul olevad lehed näevad välja väga erinevad, kuid need on tegelikult homoloogsed struktuurid. Neil on isegi väga erinevad funktsioonid. Kui kaktusetükid on peamiselt kaitsmiseks ja vee kadumise vältimiseks kuumas ja kuivas keskkonnas, siis tammepuul need kohandused puuduvad. Mõlemad struktuurid aitavad aga kaasa nende taimede fotosünteesile, nii et mitte kõik viimase esivanema funktsioonid pole kadunud. Sageli näevad homoloogsete struktuuridega organismid tegelikult üksteisest väga erinevaid, võrreldes sellega, kui lähedased mõned analoogse struktuuriga liigid üksteisele välja näevad.