Väikeste segavate RNA (siRNA) ja mikro RNA (miRNA) vahel on mõned erinevused ja sarnasused. Kahe ahelaga siRNA võib olla tuntud ka kui lühike segav RNA või summutav RNA. Mikro-RNA on kodeerimata molekul. Ribonukleiinhape (RNA) on vajalik bioloogiliseks kodeerimiseks ja geenide ekspressiooniks kõigis elusolendites.
Mis on siRNA ja miRNA?
Enne kui saate aru, kuidas siRNA ja miRNA on sarnased ja kuidas nad erinevad, aitab see teada saada, mis need on. Nii siRNA kui ka miRNA on proteoomika tööriistad, mida kasutatakse geeniekspressiooni erinevate aspektide uurimiseks. Proteoomika on valkude uurimine, mille käigus uuritakse raku valkude täielikku komplemendi korraga. Tehnoloogia areng on sellise uuringu teinud võimalikuks.
Kas siRNA ja miRNA on sarnased või erinevad? Žürii on selles küsimuses endiselt pisut väljas, sõltuvalt sellest, kellelt te küsite. Mõnede allikate arvates on siRNA ja miRNA samad asjad, teised aga väidavad, et nad on täiesti eraldi üksused.
Lahkarvamused tekivad seetõttu, et mõlemad on moodustatud samal viisil. Need tekivad pikematest RNA eellastest. Neid mõlemaid töödeldakse tsütoplasmas ka
ensüüm enne valgukompleksi RISC osaks saamist nimetatakse Diceriks. Ensüümid on valgud, mis võivad parandada biomolekulide vahelise reaktsiooni kiirust.Nende kahe vahel on väikesed erinevused
RNA interferentsi (RNAi) protsessi saab modelleerida kummagi abil siRNA või miRNA ja nende kahe vahel on peened erinevused. Nagu mainitud, töödeldakse mõlemat rakus ensüümi Dicer abil ja inkorporeeritakse RISC kompleksi.
siRNA-d peetakse eksogeenseks kaheahelaliseks RNA-ks, mille rakud omastavad. Teisisõnu, see siseneb läbi vektorid, näiteks viirused. Vektorid tekivad siis, kui geneetikud kasutavad geeni kloonimiseks DNA bitti geneetiliselt muundatud organismi (GMO) tootmiseks. Selles protsessis kasutatud DNA-d nimetatakse vektoriks.
Ehkki siRNA arvatakse olevat eksogeenne kaheahelaline RNA, on miRNA üheahelaline. See pärineb endogeensest mittekodeerivast RNA-st, mis tähendab, et see on tehtud raku sees. Seda RNA-d leidub suuremate RNA-molekulide intronites.
Vähesed muud erinevused
Teine erinevus siRNA ja miRNA vahel on see, et siRNA seondub loomadel tavaliselt ideaalselt oma mRNA sihtmärgiga. See sobib ideaalselt jadaga. Seevastu miRNA võib pärssida paljude erinevate mRNA järjestuste translatsiooni, kuna selle sidumine on ebatäiuslik. Translatsioon toimub pärast Messenger RNA muutmist ja seondumist ribosoomi kindla saidiga. Taimedes kipub miRNA olema täiuslikumalt komplementaarses järjestuses, mis indutseerib mRNA lõhustumist, mitte ainult translatsiooni mahasurumist.
SiRNA ja miRNA võivad mängida rolli epigeneetikas protsessi kaudu, mida nimetatakse RNA-indutseeritud transkriptsiooniliseks vaigistamiseks (RITS). Epigeneetika on päriliku geneetilise teabe uurimine, mille käigus DNA nukleotiidijärjestust ei muudeta, vaid see avaldub keemiliste märkidena. Need märgid lisatakse pärast replikatsiooni DNA või kromatiini valkudele. Samuti on mõlemad olulised terapeutilise kasutamise sihtmärgid, kuna nad mängivad rolli geeni ekspressiooni kontrollimisel.