Polügeenne pärand kirjeldab tunnuste pärimist, mille määrab rohkem kui üks geen. Need geenid, nn polügeenid, annavad spetsiifilisi tunnuseid, kui neid väljendatakse koos. Polügeenne pärand erineb Mendeli pärimismustrid, kus tunnused määratakse ühe geeni abil. Polügeensetel tunnustel on palju võimalikke fenotüübid (füüsikalised omadused), mis määratakse kindlaks koosmõjude vahel alleelid. Inimeste polügeense pärandi näidete hulka kuuluvad sellised tunnused nagu nahavärv, silmade värv, juuste värv, keha kuju, pikkus ja kaal.
Polügeense pärandi korral on tunnusele tuginevatel geenidel võrdne mõju ja geeni alleelidel on aditiivne toime. Polügeensed omadused puuduvad täielik domineerimine nagu ka Mendeli tunnused, kuid eksponeerida ebatäielik domineerimine. Sisse ebatäielik domineerimine, üks alleel ei domineeri täielikult ega varja teist. Fenotüüp on segu vanematest alleelidest päritud fenotüüpidest. Keskkonnategurid võivad mõjutada ka polügeenseid tunnuseid.
Polügeensetel tunnustel on tavaliselt a
kellakujuline jaotus elanikkonnas. Enamik indiviide pärib erinevaid domineerivate ja retsessiivsete kombinatsioone alleelid. Need isikud jäävad kõvera keskmisse vahemikku, mis tähistab konkreetse tunnuse keskmist vahemikku. Kõvera otstes olevad indiviidid tähistavad neid, kes pärivad kõik domineerivaid alleele (ühest otsast) või neid, kes pärivad kõiki retsessiivseid alleele (vastupidises otsas). Kasutades näitena kõrgust, langeb enamik elanikkonnast inimesi kõvera keskele ja on keskmise kõrgusega. Need, mis asuvad kõvera ühes otsas, on kõrged isendid ja need, mis asuvad teises otsas, on lühikesed isendid.Silmade värv on näide polügeensest pärandist. Arvatakse, et seda omadust mõjutavad kuni 16 erinevat geeni. Silmade värvi pärimine on keeruline. Selle määrab pruuni värvi pigmendi kogus melaniin et inimesel on iirise esiosa. Mustadel ja tumepruunidel silmadel on rohkem melaniini kui sarapuu või rohelistel silmadel. Sinistel silmadel pole iirises melaniini. On tuvastatud kaks silmavärvi mõjutavat geeni kromosoom 15 (OCA2 ja HERC2). Naha värvi ja juuste värvi mõjutavad ka mitmed teised silmavärvi määravad geenid.
Mõistes, et silmavärvi määravad mitmed erinevad geenid, eeldame antud näites, et selle määravad kaks geeni. Sel juhul rist kahe helepruunide silmadega isendi vahel (BbGg) annaks mitu erinevat fenotüübi võimalust. Selles näites musta värvi alleel (B) on domineeriv retsessiivse sinise värvi suhtes (b) jaoks geen 1. Sest geen 2, tumedat tooni (G) on domineeriv ja annab rohelise värvi. Heledam toon (g) on retsessiivne ja annab heledat värvi. Selle risti tulemuseks oleks viis põhifenotüüpi ja üheksa genotüübid.
Kõigi domineerivate alleelide olemasolu põhjustab mustade silmade värvi. Vähemalt kahe domineeriva alleeli olemasolu põhjustab musta või pruuni värvi. Ühe domineeriva alleeli olemasolu annab rohelise värvuse, samas kui domineerivate alleelide puudumisel tekib sinine silmade värv.
Nagu silmade värv, nahavärv on näide polügeensest pärandist. Selle tunnuse määravad vähemalt kolm geeni ja arvatakse, et ka muud geenid mõjutavad nahk värvi. Nahavärvuse määrab tumeda värvusega pigmendi melaniini sisaldus nahas. Naha värvi määravatel geenidel on kummalgi kaks alleeli ja neid leidub erinevat kromosoomid.
Kui arvestada ainult kolme geeni, mis teadaolevalt mõjutavad nahavärvi, siis on igal geenil üks tumeda nahavärvi alleel ja teisel hele nahavärv. Alleel tumeda nahavärvi jaoks (D) on domineeriv hele nahavärvi alleeli suhtes (d). Nahavärv määratakse tumedate alleelide arvu järgi, mis inimesel on. Isikutel, kellel ei ole tumedaid alleele, nahavärv on väga hele, samal ajal kui ainult tumedad alleelid pärivad, nahavärv on väga tume. Isikutel, kes pärivad heledate ja tumedate alleelide erinevaid kombinatsioone, on erineva nahatooni fenotüübid. Neil, kes pärivad paarisarvu tumedaid ja heledaid alleele, on keskmine nahavärv. Mida rohkem tumedaid alleele päritakse, seda tumedam on nahavärv.