Mis on kolme domeeni süsteem?

Kolme domeeni süsteem, Carl Woese poolt 1990. aastal välja töötatud süsteem on bioloogiliste organismide klassifitseerimise süsteem.

Enne seda, kui Woese avastas arhaea, mis erines bakteritest 1977. aastal, arvasid teadlased, et on vaid kahte tüüpi elud: eukarüa ja bakterid.

Kõige kõrgem positsioon, mida varem kasutati, oli "kuningriik", mis põhineb 1960ndate lõpus vastu võetud Viie kuningriigi süsteemil. See klassifitseerimissüsteemi mudel põhineb Rootsi teadlase välja töötatud põhimõtetel Carolus Linnaeus, mille hierarhiline süsteem grupeerib organisme ühiste füüsikaliste omaduste alusel.

Kui teadlased saavad organismide kohta rohkem teada, muutuvad klassifitseerimissüsteemid. Geneetiline järjestamine on andnud teadlastele täiesti uue viisi organismidevaheliste suhete analüüsimiseks.

Praegune kolme domeeni süsteem rühmitab organisme peamiselt ribosoomide erinevuste põhjal RNA (rRNA) struktuur. Ribosomaalne RNA on molekulaarne ehitusplokk ribosoomid.

Selle süsteemi kohaselt klassifitseeritakse organismid kolme valdkonda ja kuus kuningriiki. Domeenid on

• Archaea
• Bakterid
• Eukarya

Kuningriigid on

• Arhebakterid (iidsed bakterid)
• Eubakterid (tõelised bakterid)
• Protista
• Seened
• Planeedid
• Animalia

See Archaea domeen sisaldab üherakulisi organisme. Archaea on geenid mis on sarnased mõlemale bakterid ja eukarüootid. Kuna need on välimuselt väga sarnased bakteritele, eksisid nad algselt bakterite vastu.

Nagu bakterid, on ka arhaea prokarüootsed organismid ja neil ei ole membraaniga seotud tuum. Neil puudub ka sisemine rakk organellid ja paljud on umbes sama suured kui bakterid ja sarnase kujuga. Archaea paljunevad binaarse lõhustumise teel, neil on üks ümmargune kromosoom, ja kasutage flagella keskkonnas ringi liikuda, nagu ka bakterid.

Archaea erinevad bakteritest raku sein koostis ja erinevad nii bakteritest kui ka eukarüootidest membraan koostis ja rRNA tüüp. Need erinevused on piisavalt suured, et õigustada arhaea eraldi domeeni olemasolu.

Archaea on äärmuslikud organismid mis elavad kõige ekstreemsemates keskkonnatingimustes. See hõlmab hüdrotermilisi õhuavasid, happelisi allikaid ja Arktika jää all. Archaea jagunevad kolmeks peamiseks fülaks: Crenarchaeota, Euryarchaeotaja Korarchaeota.

• Crenarchaeota Siia hulka kuuluvad paljud organismid, mis on hüpertermofiilid ja termoatsidofiilid. Need arhaea arenevad väga ekstreemsete temperatuuridega keskkondades (hüpertermofiilid) ja eriti kuumade ja happeliste keskkondade (termoatsidofiilid) keskkonnas.
• Archaea, mida tuntakse metanogeenidena, on: Euryarchaeota varjupaik. Need toodavad metaani kui ainevahetuse kõrvalsaadus ja vajavad hapnikuvaba keskkonda.
• Sellest on vähe teada Korarchaeota archaea, kuna on leitud vähe liike, kes elavad sellistes kohtades nagu kuumaveeallikad, hüdrotermilised õhuavad ja obsidiaanide basseinid.

Bakterid klassifitseeritakse bakterite domeeni alla. Neid organisme kardetakse üldiselt, kuna mõned neist on patogeenne ja mis on võimeline haigusi põhjustama.

Bakterid on aga eluks hädavajalikud, kuna mõned neist on bakterid inimese mikrobiota. Need bakterid täidavad olulisi funktsioone, näiteks võimaldavad meil toitaineid toitainetest korralikult seedida ja neisse imenduda. Nahal elavad bakterid takistavad patogeensete mikroobide koloniseerimast piirkonda ja aitavad samuti aktiveerida immuunsussüsteem.

Bakterid on ka olulised toitainete ringlussevõtt globaalses ökosüsteemis, kuna nad on peamised lagundajad.

Bakterid omavad ainulaadset rakuseina koostist ja rRNA tüüpi. Need on jaotatud viide põhikategooriasse:

• Proteobakterid: See varjupaik sisaldab suurimat bakterirühma ja hõlmab E.coli, Salmonella, Heliobacter pylori ja Vibrio. bakterid.
• Sinivetikad: Need bakterid on võimelised fotosüntees. Värvi tõttu on neid tuntud ka sinakasroheliste vetikatena.
• Firmutes: Nende gram-positiivsete bakterite hulka kuuluvad Clostridium, Bacillusja mükoplasmad (rakuseinteta bakterid)
• Chlamydiae: Need parasiitsed bakterid paljunevad oma peremehe rakkudes. Organismide hulka kuuluvad Chlamydia trachomatis (põhjustab klamüüdia STD-d) ja Chlamydophila pneumoniae (põhjustab kopsupõletik.)
• Spirochetes: Nendel korgitsmekujulistel bakteritel on ainulaadne keerdusliikumine. Näited hõlmavad Borrelia burgdorferi (põhjustada puukborrelioosi) ja Treponema pallidum (põhjustada süüfilist.)

Eukarya domeen hõlmab eukarüoote või organisme, millel on membraaniga seotud tuum.

See valdkond on veel jagatud kuningriikideks

• Protista
• Seened
• Planeedid
• Animalia

Eukarüootidel on rRNA, mis eristub bakteritest ja arheanidest. Taim ja seened organismid sisaldavad rakuseinu, mille koostis on bakteritest erinev. Eukarüootsed rakud on tavaliselt antibakteriaalsete ravimite suhtes resistentsed antibiootikumid.

Selle domeeni organismide hulka kuuluvad protistid, seened, taimed ja loomad. Näited hõlmavad vetikad, amööb, seened, hallitusseened, pärm, sõnajalad, samblad, õistaimed, käsnad, putukad ja imetajad.

Organismide klassifitseerimise süsteemid muutuvad aja jooksul tehtud uute avastuste abil. Varasemad süsteemid tunnistasid ainult kahte kuningriiki (taimne ja loomne). Praegune kolme domeeni süsteem on parim organisatsiooniline süsteem, mis meil praegu on, kuid uue teabe saamise korral võib hiljem organismide klassifitseerimise süsteem erineda olla arendatud.

Nii võrreldakse viie kuningriigi süsteemi kolme domeenisüsteemiga, millel on kuus kuningriiki:

Viis kuningriigi süsteemi:

• Monera
• Protista
• Seened
• Planeedid
• Animalia